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ぱんだのびぼーろく

わたしの備忘録、生物学とプログラミングが多いかも

ゼブラフィッシュのGal4-UAS 遺伝子導入

Gal4-UASの種類

  • Gal4 VP16 UAS
  • UASリピート数

疑問点

  • UASリピート数と転写効率
  • UASの実配列

リピート数

継代時のsilencingがかなり問題になるみたい.
www.researchgate.net

UAS実配列

UASgの実配列は

5'-CGGAGTACTGTCCTCCG-3'

と思われる。 川上研のTol2-UAS vector (下記) から、該当領域付近の5連続相同配列を見繕ったらあった

キホン

Gal4

酵母由来

開発

初登場はハエ (1993)

To create GAL4-responsive target genes, we designed a vector into which genes can be subcloned behind a tandem array of five optimized GAL4 binding sites (hereafter referred to as the UAS, for Upstream Activation Sequence)

Targeted gene expression as a means of altering cell fates and generating dominant phenotypes | Development

UAS

The yeast UASG is a transcriptional enhancer in human HeLa cells in the presence of the GAL4 trans-activator. - PubMed - NCBI

near-consensus GAL4 binding site (17M)
5'-CGGAGTACTGTCCTCCG-3'

ScaⅠサイトを作るために改変

#

色んなpromoterの前にある配列を比較してる論文

www.ncbi.nlm.nih.gov

#

minimal promoterの合成

The development and characterization of synthetic minimal yeast promoters : Nature Communications

#

tol2kitとかいうwiki
プラスミド情報が載ってる

P5E-UAS - Tol2kit

日本語

川上研究室

ゼブラフィッシュ

ゼブラフィッシュでのパイロット実験

"Use of the Gal4-UAS technique for targeted gene expression in the zebrafish"
Nico ScheerJosé A. Campos-Ortega. 1999.
Use of the Gal4-UAS technique for targeted gene expression in the zebrafish

The coding region is under the control of five copies of an optimized UAS from yeast and the minimal E1b promoter of adenovirus (Argenton et al., 1996).

"An activation domain of the helix-loop-helix transcription factor E2A shows cell type preference in vivo in microinjected zebra fish embryos."
F Argenton, Y Arava, A Aronheim, and M D Walker. 1996.
www.ncbi.nlm.nih.gov
UASLineは貰ったよ、くらいしか記述なし。

UAS vector

川上研、5xUAS

kawakami lab

Zfin UAS系統

ZFIN Engineered Region: UAS